Hệ thống cấp thoát nước ngầm:
Với công nghệ Canada và công suất 950,3 m3/ngày, hệ thống cấp nước ngầm tại Chợ Đầu Mối Nông Sản Thực Phẩm Thủ Đức được thiết kế với chức năng khử Sắt, Mangan, nồng độ PH, loại trừ các vi khuẩn có hại, Nước sau khi xử lý đạt tiêu chuẩn TCVN 5501-91, rất an toàn cho nhu cầu sinh hoạt của tiểu thương và dân cư.
Trạm xử lý nước thải:
Nước thải tại khu vực Chợ được tập trung vào hầm bơm và chuyển qua hệ thống xử lý nước thải. Với công nghệ Đan Mạch và công suất 1.500 m3/ngày, hệ thống xử lý làm sạch nước và không làm ô nhiễm môi trường sông rạch.
Trạm xử lý rác:
Với 2 máy ép rác theo công nghệ ép kín và công suất 64 tấn/ngày, trạm xử lý có khả năng xử lý 50-60 tấn rác được thu gom mỗi ngày tại Chợ. Rác sau khi ép được đưa vào bãi rác của thành phố. Nước thải ra được dẫn qua trạm xử lý nước thải.